Container tồn đọng làm giảm năng lực thông quan tại các cảng hàng hóa.
Hiện tại một số cảng biển trong cả nước vẫn tồn đọng lên đến hàng chục nghìn container phế liệu. Tình trạng này đã gây nên ách tắc, chiếm dụng kho bãi tại các cảng biển, ảnh hưởng đến năng lực thông quan của cả cơ quan kinh doanh và cơ quan Hải quan. Ông Nguyễn Khánh Quang - Phó Cục trưởng Cục Điều tra Chống buôn lậu, Tổng cục Hải quan cho biết, thực tế từ các vụ việc mà cơ quan Hải quan điều tra và khởi tố thì nhiều doanh nghiệp có giấy phép nhưng không hề sản xuất và không đủ điều kiện về cơ sở vật chất, nhà xưởng, máy móc, thiết bị để sản xuất… Như vậy, là cơ quan cấp phép là không chính xác. Về quy định thông báo lô hàng nhập khẩu, ngành Tài Nguyên và Môi trường quy định doanh nghiệp chỉ cung cấp cho hải quan giấy photo, do đó trách nhiệm này đầu tiên thuộc về cơ quan Tài nguyên và Môi trường. Ông Nguyễn Khánh Quang nói:
Hải quan dưới sự chỉ đạo của Bộ Tài chính cũng đang thực hiện hết trách nhiệm, nỗ lực hết trách nhiệm của mình trong đó cùng với các ngành chức năng rà soát trong tổng số hàng chục nghìn container như vậy cái nào là hợp lệ hợp pháp về mặt thủ tục, cái nào sai về thủ tục nếu như doanh nghiệp không đến làm thủ tục nhận hàng thì không phải đơn giản để cơ quan chức năng mở ra xem được. Do đó, trong những cuộc họp gần đây chúng tôi đề xuất với Chính phủ có cơ chế xử lý mới hơn khác với cơ chế hiện hành bởi nếu theo cơ chế hiện hành sẽ cực kỳ lâu.