Hiện Kiểm toán Nhà nước có 13 đơn vị khu vực, mỗi đơn vị phụ trách 4-6 tỉnh, thành, thực hiện kiểm toán báo cáo tài chính, tuân thủ, hoạt động và các nhiệm vụ khác. Hoạt động thời gian qua đạt hiệu quả cao, tiến độ và chất lượng kiểm toán cải thiện rõ rệt, phương pháp tiếp cận tiệm cận chuẩn mực quốc tế.
Theo đề xuất, 3 đơn vị khu vực III, VIII và XII sẽ sáp nhập thành 2 đơn vị, đặt trụ sở tại Đà Nẵng và Khánh Hòa. Sau sắp xếp, còn 12 đơn vị khu vực, phân bố đều cả nước, vị trí trụ sở thuận lợi, không phát sinh xây dựng mới, tiết kiệm ngân sách. Mỗi đơn vị có 75-85 công chức, trong đó 60-70% kiểm toán tài chính và tuân thủ, 30-40% kiểm toán hoạt động, chuyên đề, công nghệ thông tin.
Chủ nhiệm Ủy ban Pháp luật và Tư pháp Hoàng Thanh Tùng cho rằng phương án phù hợp chủ trương tinh gọn bộ máy, không phát sinh chi phí cơ sở vật chất. Việc rút ngắn thời hạn quyết toán Ngân sách nhà nước từ 18 xuống 12 tháng, cùng yêu cầu hoàn thành báo cáo sớm và bỏ thẩm định quyết toán của cơ quan tài chính, sẽ tăng áp lực cho Kiểm toán Nhà nước.
Cơ quan thẩm tra đề nghị Kiểm toán Nhà nước đẩy mạnh ứng dụng công nghệ thông tin, trí tuệ nhân tạo, chuyển đổi số, đồng thời đào tạo, bồi dưỡng nâng cao trình độ kiểm toán viên, bảo đảm hiệu lực, hiệu quả kiểm toán; phục vụ tốt công tác giám sát và quyết định của Quốc hội, HĐND. Ủy ban Thường vụ Quốc hội quyết định số lượng đơn vị theo Luật Kiểm toán Nhà nước, còn địa điểm trụ sở giao Tổng Kiểm toán Nhà nước quyết định.
100% Ủy viên Ủy ban Thường vụ Quốc hội có mặt biểu quyết thông qua Nghị quyết, giao Thường trực Ủy ban Pháp luật và Tư pháp phối hợp Kiểm toán Nhà nước hoàn thiện, trình Chủ tịch Quốc hội ký ban hành.