Theo dự báo, Vân Đồn và Cát Bi là hai sân bay nằm trong vùng chịu tác động mạnh của bão. Các sân bay Nội Bài, Thọ Xuân, Vinh và Điện Biên được yêu cầu theo dõi chặt chẽ diễn biến thời tiết, cập nhật liên tục thông tin và sẵn sàng kích hoạt phương án phòng chống trong trường hợp bão đổi hướng hoặc tăng cường độ.
Cục HKVN giao Tổng công ty Cảng hàng không Việt Nam (ACV) chủ trì, phối hợp với các đơn vị liên quan kiểm tra toàn bộ hệ thống hạ tầng kỹ thuật, thông tin liên lạc, đài trạm... nhằm phát hiện, xử lý kịp thời sự cố và bảo đảm an toàn tuyệt đối cho hoạt động khai thác. Các đơn vị phải chủ động biện pháp phòng chống ngập úng, khơi thông dòng chảy, bảo vệ công trình, phương tiện, thiết bị, giảm thiểu thiệt hại do mưa bão gây ra và nhanh chóng khôi phục hoạt động sau khi thời tiết ổn định.
Đối với các sân bay đang thi công như Cát Bi và Vinh, Cục yêu cầu chủ đầu tư và nhà thầu lập tức triển khai phương án ứng phó, xác định điểm dừng kỹ thuật, chuẩn bị sẵn nhân lực, vật tư để khắc phục nhanh sự cố, bảo đảm an toàn công trình và người lao động.
Cục HKVN cũng lưu ý, sau khi bão suy yếu và đổ bộ vào đất liền, mưa lớn kéo dài có thể tiếp tục gây ảnh hưởng đến hạ tầng hàng không. Vì vậy, Tổng công ty Quản lý bay Việt Nam (VATM) được yêu cầu tăng cường theo dõi, cập nhật bản tin dự báo, cảnh báo thời tiết, cung cấp đầy đủ, kịp thời thông tin cho các hãng hàng không và cơ quan điều hành bay để điều chỉnh lịch trình hợp lý.
Các hãng hàng không phải chủ động theo dõi sát diễn biến bão, điều chỉnh kế hoạch hoặc lịch bay khi cần thiết, nhằm bảo đảm an toàn tuyệt đối cho hành khách, tổ bay và phương tiện. Cục nhấn mạnh việc phối hợp chặt chẽ giữa các đơn vị cung cấp dịch vụ hàng không, khí tượng và cảng vụ để hạn chế tối đa ảnh hưởng của bão đến hoạt động khai thác.
Cảng vụ Hàng không ền Bắc được giao nhiệm vụ giám sát, đôn đốc các cảng hàng không triển khai biện pháp ứng phó, duy trì thông tin liên lạc thông suốt với Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn của Cục HKVN cùng các cơ quan chức năng trong mọi tình huống.
Liên quan đến bão Matmo, ngành đường sắt cũng thông báo tạm ngừng đôi tàu MR1/2 trong hai ngày 5 và 6/10 để đảm bảo an toàn. Hành khách có vé trên các chuyến tàu này có thể đổi hoặc trả vé trong vòng 30 ngày tại các nhà ga.