Danh sách các tuyến tàu tạm ngưng:
- Ngày 28/9/2025: Ngừng chạy tàu NA1, NA2, MR1 và MR2.
- Ngày 29/9/2025: Ngừng chạy tàu NA1, NA2, MR1, MR2, SE1, SP3, SP4, SP7.
- Ngày 30/9/2025: Ngừng chạy tàu NA1, NA2, SE9, SE10, SP8, SP3, SP4, SP7..
- Ngày 01/10/2025: Ngừng chạy tàu SP8.
Bên cạnh đó, mưa lũ gây ngập đường sắt tại Khu gian Thị Long – Văn Trai (tỉnh Thanh Hóa), không đảm bảo an toàn chạy tàu, ngành đường sắt tổ chức chuyển tải hành khách bằng đường bộ các mác tàu từ ga Thanh Hóa đến ga Trường Lâm và ngược lại, cụ thể:
- Tàu SE9 xuất phát ga Hà Nội ngày 29/9/2025 với SE10 xuất phát ga Sài Gòn ngày 28/9/2025
- Tàu SE3 xuất phát ga Hà Nội ngày 29/9/2025 với SE4 xuất phát ga Sài Gòn ngày 28/9/2025
- Tàu SE19 xuất phát ga Hà Nội ngày 29/9/2025 với SE2 xuất phát ga Sài Gòn ngày 28/9/2025 và SE20 xuất phát Đà Nẵng ngày 29/9/2025.
Dự kiến số lượng chuyển tải hành khách bằng đường bộ các tàu trên là 1.113 hành khách.
Tính đến 9h sáng 30/9/2025, ngành đường sắt đã phục vụ ễn phí hơn 2.000 bữa phụ (bữa sáng) và 850 bữa ăn chính cho hành khách trên các chuyến tàu bị ảnh hưởng